Năm 2012, Kalibata đã được trao Giải thưởng Yara (nay gọi là Giải thưởng Thực phẩm Châu Phi), công nhận một cá nhân hoặc tổ chức xuất sắc dẫn đầu nỗ lực thay đổi thực tế canh tác ở Châu Phi.[1]

Năm 2018, Đại học Liege, Bỉ đã trao cho cô một bằng tiến sĩ danh dự cho vai trò lãnh đạo xuất sắc (2018).[1]

Cô là người nhận Huân chương Phúc lợi Công cộng NAS 2019: được Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia mô tả là giải thưởng uy tín nhất, huy chương này được trao hàng năm cho một nhà khoa học sử dụng khoa học vì lợi ích cộng đồng.[1]